鼓励国家级经开区复制推广自贸试验区、自主创新示范区等试点经验，率先将国家科技创新政策落实到位，成效明显的可加大政策先行先试力度，打造成为科技创新集聚区。在服务业开放、科技成果转化、科技金融发展等方面加强制度创新。对新兴产业实行包容审慎监管。
国家级经开区内科研院所转化职务发明成果收益给予参与研发的科技人员的现金奖励，符合税收政策相关规定的，可减按50%计入科技人员工资、薪金所得缴纳个人所得税。据千讯咨询发布的的《中国金融市场前景调查分析报告》显示，鼓励国家级金融经开区对区内企业开展专利导航、知识产权运营、知识产权维权援助等给予支持。经济技术开发区经历一轮轮的升级之后，虽然带有一定性质的探索功能，但更多的是承接地方经济发展和招商引资的功能，并且在全国东中西部已经基本形成了覆盖网络。
自贸试验区是改革创新的试验田，更多的是承担先行先试的功能。把自贸试验区内已经成熟的经验复制推广到经济开发区，减少了经开区试错的成本，提高了效率。国家级经开区某种程度上承担了“中转站”的功能，把自贸试验区中好的经验放到经开区中进一步试验、加工，使得创新举措更加接地气。
今后国家级经开区应更加注重发挥企业家才能，加强知识产权保护，维护市场秩序，减轻企业家创新风险；推进市场导向的科技创新，通过竞争引导资金、人才、技术等创新要素向优势企业集聚；激励企业到国际市场参与竞争，在海外建立研发中心，以充分利用国外科技资源。