从内部来看，珠三角内港口整合也是广州港目前重点工作之一，并在2018年取得积极进展。广州港出资5.038亿元取得了中山港主体企业中山港航集团52.51%的股权。茂名方面，广州港集团在茂名港博贺新港区投资建设的4个10万吨级通用泊位已于2017年10月开工建设，计划2019年投产。由广州、佛山、中山三市共同投资建设的南沙港区四期自动化集装箱码头开工建设。下一步将加快优化珠江口内和珠江西岸港口资源和港口功能布局，实现大湾区港口群功能合理分工、深度融合、错位发展。
而对客户来说，千讯咨询发布的《中国港口市场前景调查分析报告》显示，港口整合的消息或许是喜忧参半。一方面，整合意味着服务更优化，“有竞争才有进步，竞争会促进码头经营商提高效率，提升服务水平，并发展出错位竞争的合理格局。珠三角内的港口整合应有利于资源的合理分配和利用。
另一方面，也有人担心简单整合之后某个港口一家独大，抬升价格。如果整合以后简单地把价格抬高，服务却没改善，那这个整合是失败的。因此，长期来看，真正的挑战在整合之后。如何在整合后真正发挥港口群作用，为客户提供更优质的服务才是核心。以优化资源分配为例，珠三角港口群整合后，应形成一个有序的物流格局，充分发挥水运大运量、低排放的优势，减少无序的、高排放的物流。
比如一些在东岸的货物，可以在东岸就下海，没必要运到西岸来。同样，珠西的货物可以在南沙、珠海等地出海，要是硬是拉到珠东港口，再建第三个虎门大桥都不足以承担货运压力。此外，港口整合后也应尽量减少重复、无效的岸线开发，避免整个社会资源的过度浪费。港口整合工作是为了继续更好地服务实体经济，做有价值的服务。