当前农村土地面临的主要问题，一是农村土地的集体所有性质，导致其难于有效发展非农产业。农村集体的土地被承包分田到户后，村集体无权强制对承包地统一收回与集中开发。按照平等自愿有偿的原则，承包地规模集中需要一家一户去谈判，土地统筹利用的成本很高，乡村土地用于产业发展的效率较差。
农用地肩负着保障粮食安全的重要作用，其用途受到严格限制。农用地限用于农业生产，农用地上不能盖楼、办厂、搞房地产。在乡村振兴过程中，能够带动农村经济振兴发展的产业，往往是旅游业为代表的非农产业。千讯咨询发布的《中国土地市场前景调查分析报告》显示，这些新产业、新业态用地要求在现有土地管理体制下并不能得到充分满足。
当前，农村土地集体所有的性质与用途限制，导致农村土地不能与城市国有土地同地同价，这是农村土地制度的主要问题。其根本原因在于，我国土地指标化管理的制度不够完善，人为划定各种性质、指标的土地，而不同性质、指标的土地用途管理不够灵活，造成土地供给不能顺应经济发展的现实需要。
以乡村旅游业为例，由于其迅猛发展，已经冲击了农村建设用地的现有规模。目前，我国乡村旅游的产值与市场已占到整个旅游业的1/3以上，乡村旅游已成为旅游业发展中潜力最大、发展最快的板块。乡村旅游业被作为农村新产业、新业态得到迅速发展，可能会带来农村建设用地规模的扩张。此外，新业态融合、农区空间复合利用增多，使现行农村土地。
人才方面，乡村地区经济发展相对城市落后，就业机会较少、发展空间较小；资金方面，农村地区的产业类型以农业相关产业为主，经济回报少、经营周期长、前期投入大等特征使社会资本资金缺乏进入农村的意愿。如果农村不能发现自身的优势与差异性，那么农村就很难通过市场竞争获得优质的人力、资金要素。
今年的一号文件以“坚持农业农村优先发展做好‘三农’工作”为主题，明确提到：优先满足“三农”发展要素配置，坚决破除妨碍城乡要素自由流动、平等交换的体制机制壁垒，改变农村要素单向流出格局，推动资源要素向农村流动。