专项附加扣除的落地，涉及到家庭、教育、医疗、住房等信息，这些信息能否及时地整合到个税征收系统，减少纳税人申报负担的同时，又能避免虚假金融信息的泛滥，是个重要问题。
纳税人在填写提交相关信息时，需要留存备查资料，像贷款合同、住房合同之类的。备查资料是抽查还是需要提前确认，有待更具体的细则出台。据千讯咨询发布的的《中国金融市场前景调查分析报告》显示，出于金融简化操作的考虑，纳税人通过APP端提交信息应该没问题，重点在于后台数据的比对，这么多不同信息的录入，如何进行核实很重要。像住房贷款合同，如果能跟银行贷款数据接上，数据比对就会比较畅通；还有如何确认父母与子女间的血缘关系，也需要其他数据的支持。
从培训材料来看，需要填报的信息包括：配偶信息、子女信息、就读学校、继续教育证书名称、房屋证书信息、住房贷款信息、出租房屋信息、被赡养人信息、分摊方式等。为保证减税红利的切实落地，员工若未及时报送相关信息，可在以后月份补报，单位在剩余月份发放工资时补扣，不影响纳税人享受专项附加扣除。
单位作为扣缴义务人的，需要按规定妥善保存备查扣除资料，并对纳税人报送的信息和资料保密。纳税人对真实性、准确性、完整性负责，扣缴义务人发现信息不符的，可以要求修改，拒绝修改，应当报告税务机关。
针对自然人的纳税信息系统正在日夜赶工，会有大量外部信息加入。纳税人提交的资料是否真实，届时可通过跨部门信息交换加以确认。距离2019年1月还只剩十几天，可以预见涉及到千万人的个税改革，会牵涉到很多具体细节。