抽检合格率持续走高，与人民群众的认同感、获得感不高之间的矛盾。这其中既有抽检合格率，尤其是食用农产品抽检合格率还不能全面、真实反映食品安全状况等因素，也有食品安全谣言、欺诈和虚假宣传以及假冒伪劣等社会因素对消费者感受的影响。
千讯咨询发布的《中国食品市场前景调查分析报告》显示，食品安全标准体系建设滞后与发现防控风险要求增高之间的矛盾。一方面是新技术、新材料的广泛使用带来未知风险因素的广泛增加，另一方面是食品安全标准与监管实际需求，以及标准的基础研究和保障能力与建立“最严谨的标准”要求相比，尚存在一定的差距。
企业主体责任落实不到位与核查处置风险防控精准定位之间的矛盾，一些生产企业进货把关不严，食用农产品市场开办者主体责任履行不到位，销售者进货凭证缺失，不合格食品无法追溯，核查处置和风险防控难以精准定位。
信息公开与地方保护、企业利益之间的矛盾。不合格食品信息公开对食品生产经营企业影响较大，不可避免地与企业利益与企业所在地的地方利益存在矛盾。
食品安全是最基本的民生，是人民群众美好生活最基本的需要，是全社会的共同期盼。食品安全抽检工作要在优化“放管服”的营商环境下，通过抽检监测发现风险，及时警示和指导企业控制风险，及时提醒消费者规避风险；要深入学习贯彻党的十九大精神和习近平总书记关于食品安全的战略思想，以满足人民群众“吃得放心”为目标，深入推进食品安全抽检监测工作再上新台阶。