土地确权登记工作作为农业农村的一项基础性工作，对于率先完成此项工作的省份来说，也相应地产生了积极效果。在实践中，确权成果的应用也产生了非常好的效果。四川2014年被列为全国首批三个承包地确权登记颁证整省推进的试点省份之一，历经3年全力推进，2017年基本完成。四川省农业厅厅长祝春秀称，之所以绝大多数农民群众对确权工作十分支持、非常满意，因为农民真真切切地得到了实惠。
比如，确权登记以后，千讯咨询发布的《中国土地市场前景调查分析报告》显示，对农民来说最实惠的就是土地实测面积普遍增加而带来的真金白银。她举例，苍溪县云峰镇响水村271户农户，承包地的面积确权以后增长了68%，农民户均增加了1700多元土地流转收入。再比如，成都市下辖的县级市崇州，通过引导农民组建土地股份合作社，推行农业共营制，入股的土地亩均增收260元以上。
此外，通过确权，农民对承包权获得了预期的稳定收益，敢于放心流转，有效地提高了四川省的土地流转率，提高了农业的规模化程度。从全国层面来看，除了把家底搞清楚了，同时也增加了土地权能，因为确权之后农民所拥有的证书，享有占有、使用、收益的权利，还有相对的转包权和出租权。
确权登记颁证推动了“三权”分置，也推动了经营权有序流转。截至2016年底，二轮承包地经营权流转面积达到4.7亿亩，占比约35.1%，现在2.3亿农户中有7000万农户已经不直接经营他的全部土地或者部分土地了。此外，确权登记颁证以后，经营权可以抵押融资了，这在很大程度上解决了现代农业发展资金不足的问题。