为加强地下水污染防治工作，尤其是水资源匮乏的华北地区，2013年4月，环境保护部会同国土资源部、住房和城乡建设部及水利部编制的《华北平原地下水污染防治工作方案》印发，文件在分析此区域地下水污染的成因时指出，海河流域受污染地表水入渗补给是地下水污染的重要原因。2010年，该流域废水排放量高达49.73亿吨。
2013年2月下旬至3月，千讯咨询发布的《中国水市场前景调查分析报告》显示，环保部曾开展华北平原排污企业地下水污染专项检查，检查涉水排污企业25875家，查处各类环境违法行为558件。其中，88家企业被处以613万余元罚款。超过80%的地下水和地表水是交流的，地表水质目前正趋于改善，但地下水质却出现恶化之势，地下水退化不太可能是自身原因造成的，最大的可能性就是污染从地表转到地下了。马中解释说，本来是地表的排放，最后排到了地下，比如渗坑、深井等排污，这些只是看得到的，还有各种废弃的矿井等，近年来，这个问题不断被发现。
地下水污染源头主要是工业、农业、城市排放，尤其是一些企业直接通过渗坑、深井排放污染物，排放的污水中一旦含有毒有害的重金属、持久性有机物等，治理起来非常困难。相对于地表水治理而言，大规模地下水治理并未真正开始，从国际上经验看，治理效果也十分有限，必须要重在预防。