收缴电子化管理，其核心是以全国统一的标准化体系为基础，构建全国统一的缴款渠道，建立起与公共财政管理和社会信息化发展相适应的电子（电子项目可行性研究报告）化缴款新机制。因此，《通知》要求严格遵循收缴电子化全国统一标准。统一政府非税收入执收项目识别码和缴款识别码，建立政府非税收入收缴全国统一缴款渠道，实现缴款人可跨地区、跨部门、跨银行、足不出户全天候在线缴纳政府非税收入。那么如何有效地组织实施收缴电子化管理？另外在收缴电子化安全方面，应该如何把功夫做足，做到信息安全无忧？
一些地方政府在原本过手的钱被财政统一管理之后，很可能存在一些抵触情绪。如何化解原来部门利益的阻力，将在很大程度上决定这项制度安排的进展。而且这些工作可能还要具体问题具体分析，在按照标准推进的同时，要有协商协调机制。因此充分发挥非税收入原来征管部门的积极性，将是有效组织实施收缴电子化管理的核心。
此外何代欣表示，信息安全确实值得考虑。相对于税收收入纳税人信息管理的封闭性，非税收收入信息的来源更广、流程更多且分类更复杂。如何在现有信息化条件下，保证信息安全，确实很考验各个部门。他认为，建立责任机制是第一步，接下来还要有更多技术上的修正与调整，避免一些不必要的错漏，最后还要有一定的法律法规作保障。