对建立统一的城乡居民医保制度进行了总体规划部署或已全面实现整合的省份，包括北京、天津、河北、内蒙古、上海、浙江、江西、山东、河南、湖北、湖南、广东、广西、重庆、云南、陕西、青海、宁夏、新疆等。其中只有陕西省在出台的医改文件（文件项目可行性研究报告）中提出将整合后的城乡居民医保划归卫生计生部门统一管理。
此前，我国通过城镇职工基本医疗保险、城镇居民基本医疗保险（即城居保）和新型农村合作医疗（即新农合）三种制度实现了医疗保险制度的全覆盖，前两项制度由人社部管理，新农合由卫生部农村卫生管理司合作医疗处来管理。其中，新农合制度于2003年建立，截至2015年底，全国参加新型农村合作医疗人口数达6.7亿人，参合率为98.8%。城居保制度2007年建立，到2015年末，参加城镇居民基本医疗保险人数为3.76亿。
杨燕绥表示，新农合与城居保两种医疗保险制度形成的城乡分割的状况导致两者之间存在筹资标准、经办流程、保险待遇等多方面的差别。从全国范围来看，新农合的医疗报销待遇低于城镇居民，医保制度的公平性受到质疑，并且在一些地区出现了比较严重的重复参保和重复补贴的问题。