据媒体报道称，全国4亿多张公交卡的押金“变戏法般”层层截留，目前还剩多少是个谜。
一个很小的公交卡（中国公交卡市场调查研究报告）押金问题，其实也涉及到好几个层面的问题。首先是，押金的收取标准是否太高，比如是否远高于其工本费，如果过高的话，这与政府鼓励民众选择公共交通的初衷是不符的。第二个层面是，因为广大乘客缴纳而积累起来的庞大的押金账户，是否得到了严格审计，资金使用状况是否透明，是否严格用于其法定用途，是否存在被挪用等腐败风险等。第三个也是更重要的层面是，公交卡采用押金这种形式，是不是符合效率或者公平的要求。
押金是一种广泛存在于债权债务关系或租赁关系中的安排，通常是债权人或者出租人收取押金，以作为债务人或者承租人履行合同的担保。不过，押金通常涉及的合同金额相对比较大，或者涉及比较具体、重大的财物，比如房屋等。而公交卡通常涉及的乘车服务等交易的单次金额都非常小，而且公交卡本身体积小，非常容易遗失，其是否适于采用押金形式就值得怀疑。正因为押金金额小，所以公交卡遗失后多数人的反应都是另办新卡，因为小额的押金不值得付出去追还的代价，但小额的押金乘以庞大的乘客人数，就构成公交企业一笔庞大的收入。
从法律角度看，公交公司收取乘客的押金，就相当于将公交卡出租给乘客使用。初看起来，因为乘客在退还卡时可以得到押金的返还，所以仿佛是乘客获得了免费使用公交卡的权利，似乎是对乘客有利的，其实不然。首先是一些地方在乘客退卡时又会收取所谓折旧费或者手续费，这些费用本身就存在很多不规范之处，损害乘客利益。更重要的是，很多公交卡的一个重要特点是，卡本身是租赁物，却同时是乘客未来得到押金返还的凭证，乘客和公交公司之间没有其他书面协议，所以当卡丢失时，据以返还押金的唯一凭证也就失去了，而对于通常的押金来说，在凭单丢失的时候，当事人往往都仍可以依据合同等文件来寻求押金的返还。而公交卡只要一遗失，乘客交纳的押金基本上就归公交公司所有了。正因为公交卡押金的这个特点，以及其易于遗失的特点，所以最终的结果是很不利于乘客的。
好消息是，一些地方的IC卡公司表示，将取消办理以押金形式发放的城市交通卡。据报道无锡采取的新做法就是，乘客在购买IC卡时就支付办卡的费用，然后卡就归乘客所有。海口还推出了既免押金又免卡费的公交卡，只要达到最低充值额20元就可获赠新卡。这些都显然大大简化了交易，既对乘客公平，又更有效率。不过，虽然公交卡的多数使用者是城市的长期居住者，但也不排除有短期停留者，他们或许不愿购买包含了成本费的卡，所以公交企业可以选择提供两种形式的公交卡，租赁形式的公交卡继续小规模存在，为这类乘客服务。