根据11月30日证监会发布的《关于进一步推进新股发行体制改革的意见》(以下简称《意见》)，新股发行将改进网上配售方式，持有一定数量非限售股份的投资者才能参与网上申购。而根据近期沪深交易所发布的《首次公开发行股票网上按市值申购实施办法》，以及12月17日深交所的“微访谈”，市值配售（中国证券行业发展研究报告）已不再是原来的市值配售，而是蜕变为了市值申购，而且广大中小投资者的利益遭到层层的侵蚀。
首先，网下发行切去了新股发行份额的最大部分。为了确保投资基金与社保基金的需要，《意见》首先就将新股发行份额的最大部分划拨给了网下机构投资者。《意见》规定，公司股本4亿元以下的，网下配售比例不低于本次公开发行股票数量的60%；公司股本超过4亿元的，网下配售比例不低于本次公开发行股票数量的70%。余下部分向网上投资者发售。也正是基于这一规定，网上市值申购的吸引力大打折扣。
其次，网上市值申购实行“先缴款再配号”。原来的市值配售，实行的是“先中签后缴款”的配售方式，只有中签的投资者才需要按中签的数量进行缴款即可。但如今的市值申购，需要投资者“先缴款再配号”，不论投资者能否中签，都得先把款缴上去再说。这个申购方式的最大问题在于，投资者既要有股票市值，同时也要有申购的现金。这就很难保证中小投资者最大程度上持股，同时最大程度上申购。虽然深交所建议中小投资者在T-1日可卖出持有市值来申购新股，但这种做法很容易导致投资者在股票交易中出现损失。
再者，股票市值可以重复使用。深交所相关负责人17日表示，沪深两市的市值不能合并计算，申购深市新股只能用深圳市场的市值。但是，市值可以重复使用。因为中小投资者的资金量有限，能够申购的新股数量是有限的。在同一天有多只新股发行的情况下，中小投资者必须放弃部分新股的申购。因此，股票市值重复使用的结果只能是让机构投资者最大程度上受益。
其四，沪深股票市值分开计算。沪市股票市值只能参与沪市新股发行的申购，深市股票市值只能参与深市新股发行的申购。这个问题对于机构投资者来说当然不是一个问题，但对于中小投资者来说就是一个大问题。因为中小投资者的资金量与持股市值本来就有限，将两市的股票市值分开计算，这就意味着在新股发行时，中小投资者总有一边的市值是要浪费掉的，中小投资者因此能够申购的新股份额就更低了。
最后，解禁的大小非可以参与网上市值申购。根据《意见》规定，可以参与网上申购的投资者，必须是持有一定数量非限售股份的，这意味着持有解禁股份的大小非也可以参与网上市值申购。由于目前市场上解禁的大小非份额数量庞大，如果都参与网上市值申购的话，那么这些大小非又将拿走网上发行份额的很大一部份。中小投资者参与网上申购的中签率将会大大降低。