伴随着自贸区的正式挂牌，包括工行、中行、农行、建行、交行、浦发行、招行和上海银行等8家中资银行的自贸区分行也将同日获批成立。星展银行、花旗银行等外资银行也拟在上海自贸区内设点。未来还会有更多银行进入自贸区。
银行纷纷在自贸区设立分行的目的，醉翁之意不在酒。从目前公布的相关金融领域政策内容来看，金融领域的改革试点涵盖人民币资本项目可兑换、金融市场利率市场化、跨境人民币、外汇管理改革、金融机构设立开放、国际大宗交易平台建设等方面，旨在构建本币为主、本外币一体化，银行分账经营、独立核算架构下，实现自贸区面向国际的金融服务，构建与投资、贸易便利化改革相适应的金融政策框架。
对于银行而言，自贸区政策落地后反过来可以提升银行自身经营模式和风险管理改革。而自贸区分行便是一个载体，是中资银行先行先试，探索新的经营模式和风险管理的试验田。浦发银行副行长穆矢表示，与上海自贸区的试验性质一样，对银行而言，在自贸区开设分行和业务同样含有试验的概念。其作用重点是和区域试验相配合，获取区域里如何做生意的经验。建行也表示，将以自贸区作为创新平台，重点推进人民币资本项目可兑换、大宗商品交易平台、跨境人民币、贸易金融、航运金融等产品创新，参与自贸区建设成可推广复制的“试验田”。