日前，调控新政策出台后，受到关注最大的是“个人转让住房严格征收差额20%的个人所得税”。有人认为，在热点城市这一税收可能会转嫁到购房者身上，从而增加购房成本，推高房价。尤其是改善性购房需求可能会被“误伤”。此外，也不利于二手房的流通，影响市场供应。
对此，住建部政策研究中心主任秦虹认为，房产转让过程的税收本该由卖方承担，会不会直接或变相转嫁给买方，主要取决于当地市场的供求关系。如果分析一下我国目前的住房市场，可以发现，大部分城市的房产(房产行业发展研究报告)交易仍是以新房交易为主，且新房供应量充足，二手房市场规模较小，转嫁的风险有限。但在一线城市二手房的规模与新房相当，且由于城市规模大，二手房所处的位置优越，供给有刚性，所以就相对容易转嫁。
目前，我国改善性需求量还很大，为了尽量减少对真实改善性需求增加成本，切实达到抑制投机性需求，对合理的住房需求给予支持的政策目的，要继续严格执行2006年国家税务总局文件中关于确保纳税人合法权益的规定。即：“对出售自有住房并拟在现住房出售1年内按市场价重新购房的纳税人，其出售现住房所缴纳的个人所得税，先以纳税保证金形式缴纳，再视其重新购房的金额与原住房销售额的关系，全部或部分退还纳税保证金;对个人转让自用5年以上，并且是家庭唯一生活用房取得的所得，免征个人所得税。”。
当然，目前的调控政策还有进一步细化和改进的空间。秦虹表示，楼市调控涉及法律手段、行政手段和经济手段，但目前因相关法律不够完善，所以多用行政手段和经济手段。行政手段的特点是刚性较强，短期容易见效。而经济手段弹性较强，但效果出现不确定性大，如提高利率，房价会有一定的滞后反应。总的来讲，仅靠‘堵’不是长久之计，整体设计、系统改革、疏堵结合才能解决涉及面广、复杂程度高的房地产市场问题。