利用微生物处理污水实际就是通过微生物的新陈代谢活动，将污水中的有机物分解，从而达到净化污水的目的。微生物能从污水中摄取糖，蛋白质，脂肪，淀粉及其它低分子化合物。千讯咨询发布的中国微生物制剂市场前景调查分析报告显示，微生物新陈代谢类型有需氧型和厌氧型两种，因此，净化方法分为好氧净化和厌氧净化。
1.好氧净化
氧存在条件下，许多好氧微生物通过分解代谢、合成代谢和物质矿物化，在把有机物氧化分解成CO2和H2O等过程中，获寻C源、N源、P源、S和能量。污水的微生物好氧净化就是模拟上述原理，把微生物置于一定的构筑物内通气培养，高效率净化污水的方法。
2厌氧净化
微生物在严格厌氧条件下，有机物发酵或消化过程中，大部分有机物被解生成H2、CO2、H2S和CH4等气体。污水的生物厌氧净化就是根据污水经厌氧发酵后既到净化，又获得了生物能源CH4的原理。微物细胞能量转移的电子受体，由好氧条件下分子氧改变为厌氧条件下的有机物。在厌氧件下，不溶于水而难分解的大分子有机污物，被微生物的胞外酶降解为可溶性物质，再由产甲烷厌氧细菌和产氢细菌降解成低分子有酸类和醇类、并放出H2和CO2；有机酸类和类经产甲烷菌降解成H2、CO2和CH4。甲烷菌还可利用H2还原CO2，形成CH4。
近年来人们通过实践发现污泥厌氧消化工艺的运行管理要求高，比较复杂，而且处理构筑物要求密闭、容积大、数量多而且复杂，所以认为污泥厌氧消化法适用于大型污水处理厂污泥量大、回收沼气量多的情况。污泥好氧消化法设备简单、运行管理比较方便，但运行能耗及费用较大些，它适用于小型污水处理厂污泥量不大、回收沼气量少的场合。而且当污泥受到工业废水影响，进行厌氧消化有困难时，也可采用好氧消化法。
从产品结构来看，好氧净化制剂占比约为70%。
以用量更大的好氧净化微生物制剂为例。
2013年我国好氧净化微生物制剂的市场规模为12.3亿元；2014年我国好氧净化微生物制剂的市场规模为15.1亿元，同比增长22.76%；2015年我国好氧净化微生物制剂的市场规模为18.2亿元，同比增长20.53%；2016年我国好氧净化微生物制剂的市场规模为21.5亿元，同比增长18.13%；2017年我国好氧净化微生物制剂的市场规模为25.1亿元，同比增长16.74%。
预计，2022年我国好氧净化微生物制剂市场规模将达到53.5亿元。
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