在出口农产品（农产品项目可行性研究报告）监管方面，福建局建立了层次清晰、全面完整的风险分析、分类管理和日常监管制度框架，对辖区1100多家出口农产品企业实施了分类管理，指导分支机构建立了“一厂一案”或“一厂一品一案”监管方案。
从福建检验检疫局获悉，该局通过建立进出口农产品“源头管理、口岸验放”工作机制，辖区出口食品农产品不合格率逐年下降，2015年出口农产品合格率达99.75%。
该机制将进出口农产品监管工作重心从产品查验转移到生产源头管控，通过精准分析农产品质量安全风险，严格落实生产企业质量安全主体责任，科学开展企业自控有效性验证监管，强化了农产品源头管控。