2014年1-4月内蒙古高新技术产品出口6.1亿元，列全国各省市高新技术产品（中国高新技术产品行业发展研究报告）出口增速首位。2013年8月至今，内蒙古高新技术产品出口已经连续9个月实现正增长。
我区高新技术产品主要以一般贸易出口为主，来料加工装配贸易出口增速强劲。东盟、欧美地区为主要出口市场，生命科学技术产品出口独占六成以上。从经营主体来看，民营企业领军出口市场，但活力不及国有企业。
截至目前，内蒙古自治区内已获批国家级高新技术产业开发区2家，分别位于呼和浩特市和包头市，另外，鄂尔多斯等地的高新区也在积极筹划酝酿升级。