在中央环保督察“回头看”启动之际，生态环境部特意发文《禁止环保“一刀切”工作意见》，提请各中央环境保护督察组协调被督察地方党委和政府抓好落实。中央环境保护督察组进驻前后，确实存在个别“一刀切”的地方，尤其是个别基层党委、政府，由于担心督察问责，不分青红皂白，采取紧急停产、停业等简单粗暴方式应对督察，给人民群众生产生活带来不便。
具体来说，关于“一刀切”的反映主要有两种情形。一是随着环保督察执法的深入推进，督察震慑、警示效果日益显现，发生“一刀切”的是个别的、局部的、短时的，是典型的地方工业环保懒政行为。二是随着中央环保督察的全面铺开，震慑作用进一步加强，各种利益诉求纷繁复杂，一些微博、微信等自媒体不时夸大事实，进行不实炒作，混淆视听。
据千讯咨询发布的《中国工业市场前景调查分析报告》显示，对于工程施工、生活服务业、养殖业、地方特色产业、工业园区及企业、采砂采石采矿、城市管理等易出现环保“一刀切”的行业或领域，在边督边改时要认真研究，统筹推进，分类施策。对于具有合法手续且符合环境保护要求的，不得采取集中停工停产停业的整治措施；对于具有合法手续，但没有达到环境保护要求的，应当根据具体问题采取针对性整改措施；对于没有合法手续，且达不到环境保护要求的，应当依法严肃整治，特别是“散乱污”企业，需要停产整治的，坚决停产整治。
生态环境部要求，对于督察进驻期间群众环境信访问题，既要推进问题整改，也要注重政策引导，在整改工作中尽可能避免给人民群众生产生活带来不良影响。第一轮第四批中央环保督察的吉林等8省（区）公开了整改方案。中央环境保护督察组曾对吉林、浙江、山东、海南、四川、西藏、青海、新疆（含生产建设兵团）等8省（区）开展环境保护督察，并于2018年1月完成督察反馈。