新疆中葡发布《关于回复上海证券交易所2016年度报告的事后审核》公告，对该公司连续超十年主业扣非后净利润为负等问题进行回应。新疆中葡指出，由于葡萄酒产业本身属于长线产业，资金投入大，回报周期长，该公司为建设酿酒葡萄基地和为配套基地进行规模化生产，进行大量的基础设施建设和资金投入，历经多年将新疆天山北麓建造成为国内知名的酿酒葡萄产区，但也因此造成该公司较重的资金负担，生产经营受到严重影响。
同时，新疆中葡还称，自2006年开始，该公司受国家加大宏观调控力度、金融紧缩政策影响，先后退出国际贸易、房地产和其他农业综合开发等产业，据千讯咨询发布的《中国酒市场前景调查分析报告》显示，以聚焦葡萄酒行业;特别是经过2008年席卷全球的金融危机和近年来国内经济增速下滑及政策调整，国内葡萄酒行业整体盈利能力持续下行，至今国内葡萄酒行业整体尚未走出低谷;此外，随着近年来进口葡萄酒产品不断渗透国内市场，导致葡萄酒行业整体竞争日益激化。
针对2016年销售费用、管理费用和财务费用过高问题，新疆中葡指出，2016年销售费用、管理费用和财务费用的总和为2.85亿元，占本年营业收入2.65亿元的107.5%，较同行业偏高的原因是由于葡萄酒行业市场竞争日益激烈，且公司在行业内的市场占有率及品牌影响力偏低。同时随着进口酒冲击国内原酒和成品酒市场，国内品牌及地方性酒庄品牌的涌现进一步加剧区域竞争程度。为适应葡萄酒消费结构向大众化转变，产品比重由原酒、高端团购为主向中低端调整。此外，由于针对商超等渠道持续开展品牌推广及市场布局活动，致使新疆中葡相关费用较高。