由于碳交易（中国碳行业调查研究及投资价值分析报告）专业性较强，不少参与主体对此感到无从下手，出于成本考虑很多企业并未专设人员处理有关工作。控排单位大多数从事实体产业，碳资产意识薄弱，缺少专业人才。目前，在试点省市中国有企业所占比重较大，他们对碳交易持保守观望态度，参与交易的积极性不高，更多的是将其视为政治义务。另一方面，惩罚力度不足也导致参与主体对碳交易关注程度不够。在7个试点省市中，天津对未履约企业的惩罚力度是最轻的，碳交易管理办法中没有对未履约单位罚款、扣除配额做出明确规定，仅限于限期改正、不享受有关优惠政策等，这削弱了碳交易规制的权威性。
作为政府创设的市场，碳交易与一般商品不同，碳配额初始供给来自于政府，缺乏供给与价格之间的传导机制。在碳排放量核算不够精确的情况下，首次发放配额会影响到碳交易市场正常的供求关系。有些控排单位所得的配额明显过剩，过量的碳交易头寸导致价格下跌，价格与需求之间的传导机制失灵。从试点省市履约的实际情况看，许多企业并不清楚自身配额是否够用，对其经济影响没有认真测算，导致平时碳交易市场较为冷清，只在政府规定的履约快到期之前，在强制性约束下，交易市场才活跃起来。