今年农夫山泉果汁工厂仍会面临亏损，只有在年产量达到10万吨的时候才能止亏。今年农夫山泉工厂产量能达到5万吨，随着销售（销售项目可行性研究报告）情况转好，市场需求量提升，农夫山泉预计在三年内实现扭亏。
饮料商布局上游所遇到的困难并不只一个，农夫山泉方面表示正在积极应对。首先，农夫山泉在未来需要解决生产周期的问题。美国等地的橙子产品生产周期为4-6个月，我国目前生产周期仅有40天。橙子较短的生产周期意味着工厂面临原材料缺乏的局面，闲置时间较长，对于果汁生产将产生不小影响。同时，病虫灾害一直是农业发展所头疼的问题，黄龙病作为柑橘的“头号杀手”，是全世界柑橘产业所面临的共同挑战。
实际操作过程中，首先是脐橙榨汁问题。在工厂建好后，农夫山泉才发现，原来纽贺尔脐橙根本无法榨汁，这是当时全世界农产品加工行业公认的“禁区”。脐橙里含有大量的柠檬苦素前体物质，一旦加工就会转化成柠檬苦素。柠檬苦素虽然对人体有益，但却有浓重苦味，大部分消费者不能接受。