据统计，目前我国平均每3000人左右拥有1家药店（药店项目可行性研究报告），发达国家平均每6000人才拥有一家药店，而发达国家人均药店消费又远远高于我国，我国药店数量过多已是不争事实。从医药零售形势看，自去年以来，药品零售行业增速减缓，盈利水平有所下降。新版GSP认证其实带着行业长远健康发展的使命，给当前单体药店带来巨大压力。全国约4分之一的单体药店，将因管理能力不足和无法承受质量管理成本的提高，被迫关闭，这意味着，约7万家药店将被关闭。
与此同时，连锁药店在不断的运营发展中，也伴随着问题和阻碍。首先是伴随着行业市场刮起的兼并重组风潮，连锁药店发展需要大量的资金投入，虽然其在现金流上不存在问题，但却因为经营成本上升，口碑不佳，资金无法及时回款等等问题阻碍了药店发展。其次是目前药店所缺乏的人才主要集中在品类分析和优化人才、门店营运和营销From EMKT.com.cn人才、信息技术人才和店长人才，无法解决这一问题，连锁药店就无法得到有效的扩张发展。
再就是在现在市场环境背景下，连锁药店要想做强做大那就要是进行专业化和多元化的发展，其中多元化发展必须要建立在专业化的基础上进行，而连锁药店的战略定位，将决定其发展方向，同时也将决定药店未来的业态模式和盈利模式。并且，新医改的落地实施、药品价格下降以及竞争加剧等等这些都使零售药企的发展运营处境“尴尬”。