经过30多年的发展，我国水下考古事业从无到有，逐渐发展壮大。迄今为止，我国对辽宁绥中三道岗元代沉船、山东胶南鸭岛明代沉船、福建平潭大练岛元代沉船、平潭碗礁一号清代沉船、西沙群岛“华光礁一号”宋代沉船、广东“南海一号”宋代沉船等遗址进行了科学发掘，出水了一大批水下文物。
另外，先后开展了河北曹妃甸晚期沉船，天津塘沽一号沉船，威海湾一号甲午沉舰，烟台蛤堆后沉船，蓬莱墟里沉船，长岛日俄战舰，胶州湾沉舰，舟山沉船，千讯咨询发布的《中国水市场前景调查分析报告》显示，广东南澳一号、二号沉船等水下考古调查工作。我国水下考古走过了从滩涂发掘到近海打捞再到远海作业的历史进程。1974年，泉州湾宋代古船的发掘，是考古学界在海岸滩涂对古代沉船进行发掘和开展多学科合作研究的成功之作。
2007年，广东阳江“南海一号”沉船的打捞，在国际水下考古学界率先采用沉箱整体打捞技术，堪称近海沉船考古的一次创举；2007—2008年，西沙“华光礁一号”沉船的发掘，标志着我国水下考古的工作水域已经由近海扩展到了远海海域。不仅如此，我国还在内水水域，如湖泊、水库、内河、运河等水域，开展了一系列的水下考古项目，如四川彭山江口沉银遗址考古调查、安徽太平湖水域水下考古调查、湖北丹江口库区水下考古调查等，取得了丰硕的成果。