2018年深汕特别合作区全年生产总值完成53.13亿元，同比增长4%；全社会固定资产投资66.74亿元；规模以上工业增加值26.92亿元，同比增长4%；社会消费品零售总额12.97亿元，同比增长7.3%；一般公共预算收入3.44亿元，同比增长73.7%。2017年第三季度起，深圳已经将深汕合作区的GDP纳入统计中。在其超过两万亿的经济版图中，合作区的产值尚微不足道，但增长潜力不容忽视。
今年合作区经济社会发展目标是，据千讯咨询发布的《中国工业市场前景调查分析报告》显示，工业地区生产总值65亿元以上，增长22%以上；地方一般公共预算收入3.8亿元以上，增长10%以上；全社会固定资产投资110亿元以上，增长65%以上；规模以上工业增加值33亿元以上，增长22%以上。而根据上述行动计划，到2021年，合作区的GDP预期达到150亿元以上，对比2018年的GDP总量，这意味着三年间GDP大约增加1.8倍。
此外，2021年全社会固定资产投资250亿元以上；规模以上工业总产值300亿元以上；地方一般公共预算收入20亿元以上；城市人口达25万左右，人均GDP和居民人均可支配收入增速显著高于全省平均水平。相比于深圳其他10个区，150亿的经济体量即便与最小的大鹏新区（2017年GDP为330亿元）仍有一定差距，但在高速增长的预期下，合作区无疑将成为深圳一个新的增长极。
到2035年，合作区规划人口达到150万(略高于2017年深圳南山区的常住人口)，考虑到对粤东地区的“虹吸效应”，合作区内的公共配套设施将按照300万人的标准配置。目前，合作区的新设机构也已正式理顺。根据相关文件，深汕特别合作区党工委、管委会共设置11个区直机构（包括发展改革和财政局、科技创新和经济服务局、住房建设和水务局等）和5个市直部门派出机构。11个新组建的区直部门正式揭牌，新部门的“一把手”到位，筹备组去筹转正，将按照新名称、新职能开展工作。