粤港澳大湾区要寻找、建立自己的核心产业特色，并且是“多核”驱动发展，广深港引领下的产业升级、区域协同和集聚发展，是粤港澳大湾区未来的重点。当前，粤港澳大湾区各城市规划了各自的未来产业，但多有重复、同质，整体仍然在重构、调整过程中，除了深圳的电子信息产业较为发达，其他城市并未形成自己的特色，湾区整体金融产业结构也未明确。
在原有的产业基础上，粤港澳大湾区未来应进一步聚集全球先进制造业，推动新一代信息技术、生物技术、高端装备制造、新材料、文化创意等新兴产业发展，打造有国际影响力的科技和产业创新中心，并实现差异化发展，据千讯咨询发布的的《中国金融市场前景调查分析报告》显示，形成“金融服务在香港、创新研发在深圳、高端制造在珠三角”的立体层次。
在世界几大湾区的发展过程中，创新一直是占据主角的要素之一，目前大湾区的创新力仍然不足。粤港澳大部分城市仍处在工业经济阶段，存在较大转型提升空间，急需注入科技创新的力量。就湾区拥有独角兽公司的数量而言，深圳有13家、广州5家、少于北京的67家，上海的39家（详见图表二）。
与其他湾区不同，粤港澳大湾区显现出“多极”态势，广州、深圳、香港相互之间差距不大。如何有效整合广州、深圳、香港以及其他城市的资源，实现进一步的区域协同和集聚发展，将会成为粤港澳大湾区向世界一流湾区迈进的关键点；对于小城市而言，则要考虑如何融入核心城市产业链，找到自己的分工和定位。