投资组合管理是证券（证券项目可行性研究报告）投资领域广泛应用的资产管理方法，主要步骤包括：界定证券选择范围；分析各个证券的期望回报率及其承担的风险；设定各证券的权重，确定最优投资组合。早期中国产业投资基金规模小，投资项目少，不适用于投资组合管理方法。但随着近年政府引导类产业发展基金的发展壮大，简单、粗放式的投资管理方式以难以适应新形势的需要。以政府引导基金平均50亿元的规模为例，如单一项目投资额为200-1,000万元，则投资项目数量将达到500-2,500个。
如基金规模达到上百亿甚至上千亿，项目数量将更加庞大。这就凸显了运用投资组合与配置管理的理念管理基金的必要性。政府引导类产业发展基金通常具有双重目标，即经营性目标和政策性目标。经营性目标是产业投资基金的基本管理目标，即在控制风险水平的基础上提高投资收益水平；政策性目标是政府引导基金的管理目标，即重点突出、统筹兼顾，实现政府“稳增长、调结构、促就业、谋创新”的政策效果。基金经营的双重目标实际上是两对矛盾，即重点与兼顾、收益与风险的矛盾。当前国内中小企业、创业企业的发展存在三个不均衡，即区域聚集度是不均衡的。
行业发展阶段是不均衡的，不同行业中小企业的风险收益特征是不均衡的。政府引导类产业发展基金的管理目标是要在这两对矛盾、三个不均衡中寻求矛盾统一。应用组合管理的理念，可以以投资领域、投资区域、投资阶段三个维度构建投资组合，用比例、金额、限制性规定对每个组合进行配置，突出重点、控制风险。