企业年金最大的特点是长期性，从一般个体来看，投资周期长达30年左右，所积累的大部分基金（基金项目可行性研究报告）都适合长期投资，而待遇支付的预测也相对确定，对于投资机构来说是非常优质的资产。然而，在实际操作过程中，短期化倾向严重。短期化行为包括管理合同签订的短期化和考核短期化：一般企业年金投资管理合同不超过三年，甚至很多企业年金投资管理合同只有一年。同时，大多数委托人会在季度和半年度时进行投资管理人的排名考核。
我国企业年金投资运营完全按照市场化模式运作，形成了以委托人、受托人、账户管理人、托管人、投资管理人为主体的运作模式——企业及其职工为委托人，市场机构作为其他“四种人”。截至2014年底，共有34家机构获得57个企业年金管理资格。很多投资失误并非是市场波动导致的，而是跟投资管理人的投资理念和操作方式有很大的关系。
尽管规模增长大大放缓，但企业年金2015年投资数据却十分亮眼。2015年度加权平均收益率达到了9.88%，创下了2007年来的新高。值得注意的是，企业年金的投资收益近些年来并不稳定，除了2007年资本市场比较火爆，投资收益率达到41%之外，一般维持在3%-9%之间。例如，2014年为9.3%，2009年为7.78%。与此同时，缺乏长期投资的理念仍是当前市场机构在年金运营中的主要问题。