与营业税相比，增值税减少重复征收，有助于给企业减负。营业税征收管理相对简单，但由于税基为营业额，存在重复征收的先天不足，且随着流通次数的增加重复缴纳的税额就越大。如存在两上下游企业A和B，A的产品全部出售给B，两家企业所适用额营业税税率分别为5%。A的营业额为800万元，缴纳营业税40万元；B购买了A的800万产品，营业额为1000万元，缴纳50万元营业税。由于下游企业B的1000万元营业额有800万元是购买A的产品，而这800万人民币（人民币项目可行性研究报告）的产品已经缴纳了营业税，所以对企业B而言存在营业税的重复征收。而增值税由于税基为经营活动产生的增值额，避免了重复征收。假设上述两家公司所适用的增值税税率为17%，对企业B而言，其应缴纳的增值税税额为1000×17%－800×17%=34万。
可见“营改增”能减轻企业负担，现实的财政数据也验证了这一点。财政部数据显示，2014年“营改增”减少了超过95%的试点纳税人的税收负担，共计减税898亿元，也使得原增值税纳税人因进项税抵扣额的增加而减税1020亿元。弱化地方政府的产业干预，有助于推动企业优胜劣汰和市场出清。营业税为地方第一大税种，2014年地方政府营业税收入约为17713亿元，占地方总税收收入的比例为29.96%。营业税税基为企业的营业额，只要企业在运行，即使是亏损，地方政府依然能取得税收收入。各级地方政府为创税，不惜牺牲土地、环境、生态等利益，降低行业进入壁垒以吸引投资。而对于一些因产能过剩无法继续经营的企业，地方政府可能会采取行动，提高其退出壁垒，以维持其税收收入。这也是去产能举步维艰的重要原因。而增值税为中央与地方共享税种，目前央、地的分配比例一般为75%:25%，随着建筑、房地产等地方税收主要贡献行业纳入“营改增”范围，地方政府干预产业的激励降低。
减少逃税漏税，有助于加强税收监管。“营改增”全面推行后，“环环征收，层层抵扣”的链条，有助于税收部门加强税务管理。上游企业和下游企业之间也有相互监督的动力，有助于减少偷税漏税，提高征收效率。减少产业扭曲，提高资源配置有效性。在营业税和增值税并存的情况下，增值税抵扣链条不完全，不同行业的税收扭曲程度不同，降低了资源配置效率。“营改增”全面推开后，可以减少税收因素对市场的扭曲。减轻消费者负担，促进居民消费和福利改善。企业的重复征税减少了，有助于降低企业转嫁给消费者的实际成本，使消费者获得更合理的价格。