金融危机与新医改的不确定性导致药店普遍采取谨慎心理，抑制了部分镇痛药（中国镇痛药行业发展研究报告）企业开店、并购等活动，但总体毛利率仍保持增长，个别企业门店增长很快，销售也没有受到多大影响，反而上升。
2009年药店销售规模比2008年同比增长15.24%，环比增长13.65%；单店平均销售额为20.99万元，同比增长11.53%，环比增长9.95%。随着2009年下半年经济环境的继续回暖，“部分经济指标回暖”，“股市重回三千点”，很多药店都得到全面恢复。进入2010年以来，经济回暖已在大多数得到印证。同时，随着各省新医改配套文件的逐一出台，零售药店的利好利弊也日趋清晰，需求逐步释放。