据悉，更新版《乙肝指南》根据15年的中国乙肝抗病毒治疗临床经验，明确推荐强效低耐药药物（中国药物市场前景调查分析报告）作为一线用药，这必定会提升乙肝治疗疗效，从而降低因乙肝而导致的肝硬化和肝癌发生率。
《丙肝指南》推荐了在国际上已被广泛使用、在国内尚在进行临床研究的口服抗丙肝病毒药物，这有助于加速这些药物在被批准后在临床上的应用，从而让中国丙肝患者尽早获益于新疗法。
虽然自第一部《乙肝指南》在2005年发布以来，乙肝抗病毒治疗在过去十多年获得了临床普及，乙肝抗病毒治疗因此取得了巨大的进展，但不可否认在临床应用过程中仍然存在诸多使用不规范的问题。
虽然各国乙肝指南明确强效低耐药药物应作为首选的乙肝治疗药物，但在我国，仍有六、七成乙肝患者使用拉米夫定、阿德福韦酯及替比夫定等高耐药药物，尤其是在二、三线城市及农村地区，这些药物往往容易发生耐药，影响抗病毒治疗的总体疗效。
在日本、韩国、美国和欧洲，高达七成以上的乙肝患者都在使用强效低耐药的一线抗病毒药物治疗。据悉，此次更新版指南明确指出强效低耐药的代表药物替诺福韦酯和恩替卡韦为慢性乙肝初治患者的首选口服用药，而不推荐高耐药药物。
新版《乙肝指南》将有助于更好地在临床控制乙肝，但专家也指出，阻碍强效低耐药药物临床应用的另外一个障碍是患者的长期药物支付能力问题。
替诺福韦酯2013年10月获批后，目前还未进入医保，而在10年前就被用于临床的我国第一个恩替卡韦，虽然在2009年底进入全国医保，但不同省份的报销比例差别比较大，有些省份的报销比例仅为50%，而且门诊报销费用限制多，但大部分患者在门诊接受治疗，这些都导致患者无法长期坚持使用高效药物。