近年来，随着医改进程的不断推进，作为新医改核心问题之一的“以药养医”，已到了非治不可的时候。9月上旬，商务部、发改委、财政部、人社部、卫计委、食药监总局六部门联合发布《关于落实2014年度医改重点任务提升药品流通服务水平和效率工作的通知》(以下简称《通知》)，正式提出“采取多种方式推进医药分开”，而这也被市场认为是新医改终于重新考虑“医药分开”原则与实施路径的重要信号。
多年来，在“以药养医”的体制下，药品(中国药品市场调查研究报告)一直是医院和医生重要的收入来源。医院可以通过药品销售获得15%的加成收入，用来补偿医生尚欠合理的阳光收入，医院和医生均有一定的动力多开药、开高价药，最终导致我国药占比常年居高不下，平均数值一直逼近五成，而美国的这一数值则始终维持在10%左右，韩国和日本的数值相对较高，但也仅在20%左右徘徊。
我国药品销售占卫生总费用的比例偏高直接形成了我国“看病难，看病贵”的顽疾。为此，“医药分开”一度被列为新医改的核心工作之一。早在2009年，卫生部部长陈竺在“两会”期间表示，新医改方案已进入倒计时，“两会”一结束就出台，公立医院将取消15%的药品加成，用药事费、增加财政投入、提高医疗服务价格来补偿。但是，由于实施起来非常困难，各地的推进工作几年来几乎处于停滞状态。
因为，虽然几乎所有人都反对“以药养医”，所有的人都支持废除“以药养医”，但是，如果不用药品来养医院和医生，那用什么来养。
这个答案直到2012年才揭晓。作为北京公立医院改革中最受关注的部分，“医药分开”相继在友谊医院、朝阳医院、同仁医院、天坛医院、积水潭医院共五家医院开始试点。总体的思路就是去掉原先的诊疗费、挂号费;医院全部药品实现进价销售，减掉15%的加成费;与此同时按照医师职级，设置不同档次的医事服务费，最低42元、最高100元，医保患者定额可报销40元。
而这不光意味着医院和药品之间的关系切断了，同样体现了医生的劳动价值，并且有利于合理有效利用资源，避免“三级医院人满为患，社区医院门可罗雀”的现象。
“通过总结，北京‘医药分开’的试点出现了三大亮点：病人的平均次均费用降低了、住院费用降低了、大夫收入增加了。”9月18日，北京市卫计委宣传中心副主任马彦明强调，我们曾经的目标是在“十二五”期间将个人的医疗负担费用降到30%以下，如今，北京的这个数值已经降到了25%以下。
所以说，当前北京医院医药分开试点的效果不错，但此次六部委将全面推开的‘医药分开’是否会完全效仿试点医院的方案尚不得而知。