据了解，深圳市是医药分开的试点城市，该市采用“医保保运行、财政保发展”的思路，保障医药分开试点工作顺利开展。医药（中国医药市场调查研究报告）分开政策在保障医院正常运营的前提下，通过倒逼药品流通环节挤出价格水分、分流患者去基层就医等办法，探索出推进医药分开的特色经验，取得了较好的社会效果。
在推行医药分开中，深圳将原药品加成收入转换为医生看病的诊查费，即在原来各级医院诊查费的基础上，将门诊诊查费每人次平均提高12元，住院诊查费每住院床日平均增加37元，本市医保参保人员的诊查费提高部分由医保统筹基金承担，不增加患者负担。同时，深圳市还对本地户籍非从业人员的参保补助水平从每人每年200元提高到240元，对少年儿童、大学生的参保补助水平从每年每人75元提高到200元。
通过取消药品加成费用，提高诊查费价格标准，进一步完善了公立医院补偿机制，有利于推动建立体现医疗行业特点的服务价格体系和医务人员薪酬标准体系。此外，对于市属中医、精神病专科等“药占 比 ” 较 高 的 医 院 调 整 了 补 助 结构，对于确实存在合理政策性亏损的医院也加大了财政补助力度。
深圳市正是用“医保保运行、财政保发展”的思路，大力推行医药分开政策，保障医改工作顺利开展。据了解，深圳市市区两级财政每年拿出约20亿元进行补助，其中对市级医院的运营经费补贴10%，医院的基建、人才培训、大型设备购置、学科发展等项目资金也都进行了政府补贴。