“十二五”863计划生物资源与安全主题项目“特种生物资源开发利用关键技术”以重点产品和工艺开发为目标，围绕特殊菌类资源、高值经济植物、特殊药用资源以及特殊微生物资源展开研究，旨在建立一批具有中国特色和自主知识产权的特种生物资源功能菌株库、功能基因库和分子酶库，形成一批针对特种生物资源开发的技术平台，开发一批特种生物资源高附加值产品及规模化示范生产线。项目立项实施一年以来，取得了一系列重要成果。
在功能菌株库、基因库和分子酶库的建立方面：利用基因工程手段建立了农杆菌介导的灵芝转化系统，使工程菌株中灵芝酸的含量比野生型菌株提高了2倍;获得了冬虫夏草（冬虫夏草行业发展研究报告）中国被毛孢的全基因组序列和不同培养条件下的转录组序列，确定了中国被毛孢甘露醇、虫草素、嘌呤类核苷、嘧啶类核苷以及不饱和脂肪酸的合成代谢途径及相关的72个功能基因;构建了产多拉菌素工程菌的遗传改良菌种，使多拉菌素的工业发酵效价从1200mg/L提高到了1300mg/L;建立了海洋芋螺的8个芋螺毒管cDNA基因文库和7个芋螺毒液天然活性肽库，发现56个新芋螺毒素功能基因。
在特种生物资源开发利用的新工艺、新技术方面：通过酸解-乙酰化-酸解的预处理策略，建立了灵芝酸分离纯化新技术，使灵芝酸T在粗提液中的质量含量及分离度分别提升4倍和7倍;优化完善了北冬虫夏草中虫草素的提取纯化工艺，使虫草素回收率达到90%以上，已具有可单批次提取纯化100g(含量99%)虫草素的技术水平;建立了微生物胞内油脂的快速检测方法、微生物油脂全组分分析平台以及产油微生物胞内小分子物质分析平台。
在产业化与示范方面：建立了冬虫夏草中国被毛孢菌粉生产线，具有冬虫夏草中国被毛孢菌粉的生产和销售能力;建立了一条面积100平方米的肉苁蓉种苗繁殖生产线，网袋容器育苗成苗率高达90%以上;建造了小试规模的利用有机废水和发酵副产物CO2养殖经济微藻的连续系统，并在此基础上建设了一个以养猪沼液为培养基的能源微藻养殖中试工程;牵头组建了“中国虫草素产学研合作战略联盟”，为虫草素的科研及产业化开发利用奠定了基础。