近期，卫生部部长陈竺在2012年中国药学大会上表示，年内将发布2012年版国家基本药物目录，新版基药目录的适用范围将从基层医疗机构扩至各级医院。这是卫生部今年再次强调新版基药目录年内落地。
新版基药目录会在12月上旬到中旬发布，在此外界无法获得目录的内容。卫生部药政司组织了基本药物组的药品专家们进行了一次碰头会议，会议上一些专家称，即将公布的新基药目录独家品种太多，提议剔除部分品种。目前对于基药目录的争议还是比较大的，预计还会出现新的变数。
2009年8月18日，卫生部等9部门公布了《国家基本药物目录管理办法》，其中明确指出基药目录“原则上每三年调整一次”。因此2012年正好是调整窗口期。
关于新的基药目录，消息称新版“基药目录”里化学药占292种，中药（中药行业发展研究报告）占184种，民族药占21种。相比起2009版基药目录205种化学药、102种中药来说，这份“目录”扩容近70%。中药部分里大量独家品种在列，例如东阿阿胶的复方阿胶浆、灵峰药业的金鸡胶囊、万通药业的万通筋骨片等。
根据部门分工，基本药物目录的遴选和执行由卫生部负责，而实际使用中则由人保部的医保基金全额报销。大量高价的独家品种、以及此前报销比例较低的医保乙类品种入选，无疑将加大医保基金的支付压力。