深圳市在2012年将深化医药卫生体制体制机制改革，推行公立医院体制改革，包括在全国首开先河，打破“以医补药”的落后机制;率先推进公立医院法人治理改革，将公立医院定位为法定机构;并大力发展民营医院;争取在未来几年内将深圳打造成国家区域性医疗城市。
在昨天举办的2012年深圳市卫生和人口计划生育工作会议上，深圳市卫生和人口计划生育委员会党委书记江捍平主任表示，在今年创造性地完成医疗基本任务之后，推动公立医院重大体制机制改革，全面提高医疗服务质量等成为了2012年深圳市在医疗卫生工作中的重点。
公立医院体制改革一直是深圳市的亮点工作之一。自2010年深圳市率先在全国实行试点工作以来，公立医院体制改革的进程取得了稳步的发展，并在2011年取得了突破性的进展，包括草拟了医管中心管理办法和医管中心理事会章程，推动管办分离;率先在国内建立了以公益性为核心的公立医院综合目标管理责任制，推动了正式分开;同时也加大了医药分开和营利性与非盈利性分开的工作。
据江捍平主任介绍，2012年的工作会在2011年成就的基础上进一步深化，公立医院将被定义为法定机构，这在国内也是首例，并按照法定机构的设置方式，组建公立医院管理中心，实现医院“官办分开”，推动公立医院依法治理，完善卫生行业监管机制，职代会民主监督机制等多元监管机制，实现政事分开。
同时，改革也会赋予医院更多的自主权，按照政府指导和遵循市场规律双管齐下的原则，全面改革公立医院的管理，薪酬，财政补偿，员工福利等多项制度，使得公立医院在政府的有序指导下提高服务机制，加快信息化建设，从而全面提高效率和透明度。
在改革中，“以医补药”这种落后的体制将被重点改造，在原来的机制中，医院能得到15%的医药加成费，导致药品市场价格虚高和病人看不起病等一系列问题。改革后的深圳公立医院，将全面取消药品加成费，改为设立药事服务费和推行单病种付费、混合型一包付费制度等内容，且这些费用均纳入医保报销范围内，全面控制病人看病的成本，同时，政府将给予公立医院一定的财政补贴，以弥补药品加成费取消后的损失。
江主任表示，在推行公立医院体制改革的同时，民营医院也将得到发展，目前，民营医院所占市场份额只占25%，住院率只有16%,为解决民营医院发展瓶颈问题，推进营利性与非盈利性分开，深圳市会在未来几年鼓励和引进社会资本举办医疗机构，并给与一定的政策支持，同时也支持民营医院多样化发展特许医疗服务，包括高端体检，养生保健等，计划在2015年，民营医院的所占市场份额达到30%以上。
除大力深化公立医院改革外，江主任表示，2012年，深圳市将以“深圳质量”为新标杆，实施重点学科建设和医疗水平提升工程，全面提高医疗服务质量;实施医德医风建设和社会满意度提升工程，并开展卫生文化建设年活动等，持续加强深圳市卫生和医疗水平的提高。