多式联运是依托两种及以上运输方式的有效衔接，提供全程一体化组织的货物运输服务，具有产业链条长、资源利用率高、综合效益好等特点。然而，与发达国家相比，我国多式联运发展尚处于初级阶段，目前我国多式联运量仅占全社会货运量的2.9%，美国为10%左右；货物中转转运所耗费的成本约占全程物流（物流项目可行性研究报告）成本的30%，降低了运输组织效率，增加了企业经营成本。多式联运发展滞后，已成为综合交通运输体系建设的“短板”。
“十三五”时期，交通运输部将进一步完善协同联动机制，细化工作举措，加大支持力度，推进多式联运又好又快发展，努力走出一条结构优、质量高、效益好的多式联运发展新路。在营造公平竞争环境，激发市场主体活力上力见实效。深入推进简政放权、放管结合，进一步优化市场监管方式，对多式联运不增设新的行政审批事项。加强对多式联运企业经营行为的事中事后监管，开展市场运行动态监测与绩效评估，建立多式联运经营信用考核评价体系与奖惩联动机制。
持续加大车辆超限超载和车型标准化整治力度，引导不合规车辆退出市场，推动中长距离货物运输由公路向铁路、水路等运输方式转移。严格规范涉企收费行为，落实收费公示制度，降低企业经营成本。深化铁路货运市场化改革，鼓励多式联运经营企业结合市场供求与竞争形势变化、经营成本等因素合理协商定价。