1月14日13时21分，四川省乐山市境内发生里氏5.0级地震，距离震中仅40公里的成绵乐客专部分区段及车站震感明显，铁路部门紧急采取措施确保铁路运输安全。这是成绵乐客运专线开通以来首次经历地震（地震项目可行性研究报告）的考验。
地震发生时，成都铁路局根据灾害预警系统报警，及时扣停了3趟在途运行和1趟即将发车的成绵乐动车组。峨眉山站、乐山站迅速疏散候车旅客，并对扣停在站内的动车组实施安全防护措施，确保旅客人身及财产安全。由成都高铁工务段、成都供电段60余名工程抢修人员搭乘的5台轨道车也分别从成都东站、峨眉山站、绵阳站开出，对沿线的桥梁结构、供电接触网及无砟线路几何尺寸等设备进行添乘检查，确保灾后铁路设备设施安全。
15时37分，经过铁路部门两个小时的紧张排查，受乐山地震影响关闭的成绵乐客专成都东站至峨眉山站间开通，沿途被扣停的动车组逐步恢复运行。乐山5.0级地震，是成绵乐客专自2014年12月20日开通以来，经历的首次地震灾害考验。作为四川“5.12”地震灾后重建工程之一，该段线路在设计初期就引入了日本新干线的防震减灾理念，由我国自主研发的铁路地震预警防震减灾系统也被运用其中。
防震减灾系统的运用，保证了成绵乐客专在地震前几秒或者十几秒钟的时间就可接收到反馈至铁路终端的地震预警信息，从而指挥高速运行的动车组及时采取紧急制动措施，确保列车运行安全。
同时，成绵乐客专沿途的车站也在防震减灾上进行了充分考虑和设计。灾后重建的很多新站房都采用了大跨度结构，比如绵阳站、德阳站的站房屋顶就是一个弧线形的网架结构，长边最大跨度超过了90米。并且站房在施工过程中均使用了高强钢筋等新型材料，为工程结构安全提供了坚实保障。