据了解，下月底，北京地铁6号线二期开通后将与6号线一期贯通试运营，无需在中途换乘，通运门站和北运河东站暂缓开通。市交通委相关负责人表示，6号线将成为东西向城市轨道交通（轨道交通项目可行性研究报告）的快速轨道线。预计从通州潞城站到海淀五路居站只需70分钟。
根据6号线一期目前工作日客流量变化监测情况看，早高峰进城方向，从东边终点站草房站到青年路站客流压力较小，青年路到金台路区间各站，早高峰压力大。其中十里堡到呼家楼满载率在100%—120%左右。
地铁运营公司相关负责人表示，6号线一期主要面临客流增长过快与运力不足之间的矛盾，为解决此问题，今年8月1日起，6号线一期采取大小圈套跑的方式组织行车，工作日晚高峰开行草房站至车公庄西站的小圈车来缓解晚高峰期间的高客流段面问题。
该负责人说，为应对6号线一期、二期贯通运营后可能出现的大客流，计划进一步缩短6号线高峰发车间隔，早高峰发车间隔将根据客流情况考虑缩短至3分半或者3分钟，以进一步提高运力。之所以不能更快频次地发车，是还要考虑10号线以及线网的客流压力。
6号线一期、二期建成后，线路还将继续西延至苹果园公交枢纽，构成长达53.7公里的东西贯通线，乘客可在石景山苹果园上车，不经任何换乘直达通州。
为方便沿途市民乘坐地铁6号线出行，6号线二期共设集散广场约6827平方米；非机动车停车场总规划面积约9822平米，预计可停放5456辆非机动车，非机动车停车场近乎覆盖全线8座站点，将于年底前随轨道开通建设完成投入使用。
此外，由于6号线通州北关站周边正在进行地块开发，道路尚未完善，通州区政府将于年底前建设临时道路，实现通州北关站与北侧京榆旧线的联通，满足乘客接驳换乘需求，解决“最后一公里”的出行难题。通州区政府将在6号线二期终点站周边规划1处P+R停车场，目前该项目处于前期规划阶段，待建成后将充分满足小汽车接驳换乘需求。