近期，因为自然保护区内环境影响论证不充分、措施不到位，线路与其他铁路包夹居住用地、噪声影响突出，公众参与代表性不足等原因，环保部门称，将环保部18日公布，拟暂缓审批新建铁路（铁路行业发展研究报告）成都至兰州线成都至川主寺(黄胜关)段工程设计变更的建设项目(简称“成兰铁路某段项目”)环境影响报告书。
成兰铁路项目穿越包括大熊猫、川金丝猴等国家一级保护动物的8个自然保护区，项目总投资235亿元，中国中铁、中交建等两大上市公司中标了该项目的工程合约。
该项目《环境影响报告书》也承认，在施工期“生态影响主要是工程施工建设占用土地，将会改变土地使用功能，扰动地表、破坏植被，引起水土流失、景观等影响;工程涉及穿越大熊猫栖息地、宝顶沟、千佛山和安县雎水海绵礁省级自然保护区……对上述生态敏感区可能有地下水、占地、植被影响、水土流失及景观影响”;在运营期，“生态环境影响主要是路基和站场工程对动物通道的阻隔;铁路运营时的噪声、振动等因素对动物行为也有一定影响”。