千讯咨询发布的中国过滤器市场发展研究及投资前景报告显示，洁净室里存在大量可以节约能源的地方，例如暖气、通风和空调(HVAC)、工艺冷却、压缩空气以及一些其他的设施。而在节能环保日益成为制药企业追求的目标的下，洁净室的能源利用日益被制药企业所重视。如何提高洁净室的能源利用率?方法有很多，比如可以进行低断面风速设计。断面风速就是空气处理部件中空气经过过滤器或者加热/冷却盘管的速度。
在低断面风速(LFV)设计中，使用更大的空气处理器和更小的风机，从而降低空气的流速，降低能耗和设寿命成本。比如考虑换气次数，在保持洁净度的前提条件下，空气流速的降低可以降低建造及能耗成本。换气次数降低20%就可以使风机的尺寸降低50%。空气洁净度比节约能耗更重要，但是新研究成果已经有降低洁净成本的记载了。
虽然在换气次数方面没有达成共识，实际换气次数范围是90到250――比操作规程标准低很多，而且不会影响生产和洁净度。因此建议ISO第5级洁净室的换气次数大约是200，保守的上限是300。再比如，离心式压缩机。空气压缩机的改进节约了大量能源，而离心式压缩机是无油的，比螺杆式压缩机的效率高很多。
不过，离心式压缩机不能空转，即低负荷工况对离心机运行是极为不利的(>30%)，这使得他们在负载低的情况下效率很低。有两种方案，第一，离心式和螺杆式压缩机两者结合使用。选用离心机组满足基本负荷，再用小一些的螺杆式机组满足峰值负荷，压缩机组应该配有热回收系统。
第二，整个现场用高效的离心式压缩机作为一个大的压缩空气装置，外加大的储气罐和连接管道作为缓冲器。这样可以保证整个工厂维持一个恒定载荷，减轻加载与卸载对设备的损耗，并且降低能量浪费。
此外，提高洁净室的洁净度也成为药企关注的焦点。洁净室厂家指出，达到洁净度需要满足四个条件：送风洁净度、气流组织、送风量或风速以及静压差。
送风洁净度方面，要保证送风洁净度符合要求，关键是净化系统末级过滤器的性能和安装。此外，仅有合格的过滤器是不够的，还要保证运输、安装过程不损坏过滤器以及安装的严密性。
气流组织方面，在设计气流组织时应考虑这些原则：第一，尽量减少涡流，避免将工作区以外的污染带入工作区;第二，尽量防止灰尘的二次飞扬以减少灰尘对工件的污染机会;第三，工作区的气流要尽量均匀，且其风速要满足工艺和卫生要求，当气流向回风口流动时要使空气中的灰尘能有效的带走。
送风量方面，足够的通风换气量是为了稀释和排除室内污染空气，根据不同的洁净度要求，当洁净室净高较高时，适当增加换气次数。静压差方面，洁净室维持一定的正压是保证洁净室不受或少受污染、以维持设计洁净度等级必不可少地条件之一。即便是负压洁净室，它也必须有不低于它洁净度级别地相邻房间或套间维持一定地正压，负压洁净室的洁净度才能得以维持。
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