截至2016年6月，全国2.3亿农户流转土地（土地项目可行性研究报告）农户超过了7000万，比例超过30%，东部沿海发达省份农民转移多的地区这一比例更高，超过50%；全国承包耕地流转面积达到了4.6亿亩，超过承包地的三分之一。大量的土地流转背后，不乏纠纷存在。据浙江省缙云县法院近日一份调研报告介绍，该院2012年至2016年受理的农村土地承包经营权纠纷案件中，农户与流转对象之间的纠纷占案件总数78.57%，农户与发包人即村委会之间的纠纷只占案件总数21.43%。
农业部经管司人士的一份调研报告指出，对于土地经营权，要重点体现对规模经营主体发展现代农业的支持，包括鼓励中长期流转土地、保护流转到期后经营方的优先续约权、允许土地经营权用于抵押担保，以调动他们加强农田建设、培肥地力、增加投入、发展可持续农业的积极性。江苏省高级法院近日作出的一份调研报告也指出，不轻易认定流转合同无效。当出现集体经济组织决议将土地流转但遭个别农户反对的情况时，江苏高院认为，因个别农民不愿意将其承包地流转出去，而影响土地成片流转和综合开发，村民会议讨论决定为其调换价值相等或更优的承包地的，除非存在明显损害其合法权益的情形，司法应当尊重。
但如果规模经营主体改变了承包地的用途，则很难得到司法保护。江苏省泰州市中院今年2月发布了《涉农土地权益纠纷审判情况》白皮书，其中介绍，某村委会将10.08亩土地经营权出租给陈某从事造船，此后陈某因故未缴租金，土地遂被村委会交给别人使用。陈某起诉村委会要求其履行合同，当地法院以土地性质变更未经批准为由没有支持他的请求。