有机肥（有机肥项目可行性研究报告）在改良土壤和改善作物品质、减轻病虫害方面作用非常显著的作用。有资料表明，美国等西方国家的有机肥料用量已占到肥料总用量的近50%。
1）行业发展不平衡
有机肥料行业发展不平衡主要体现在地区差异、观念差异、技术差异和管理差异等方面。这些差异是由多种因素造成的，其中重要的一点在于国家缺乏对有机肥料产业发展的引导、扶持及相关的政策。
2）缺乏必要的规范
有机肥料行业刚刚起步，虽具有较大的潜力和前景，但需要一段时期去规范和管理，建立相应的规范、规程、标准等来规范和完善有机肥料行业的发展。
3）技术薄弱
我国还没有制定较为完善的技术规范和建设指南。在技术、原料利用、工厂化生产、示范区的建设等方面都存在诸多问题，如菌种、发酵方法等。另外，有机肥产业化生产、配套机器设备的研制以及相关产品标准制订工作还需加强。
4）用有机肥料生产出的农产品还没有得到消费者的认可
虽然有机食品、绿色食品、无公害食品等概念已被宣传多年，但消费者对它们的了解却很肤浅，优质农产品不一定卖出好价钱，导致了全国有机肥料市场需求不旺。