三元日前发布2013年业绩预告显示，预计公司年度经营业绩依然将出现亏损，净利为-1.85亿至-2.15亿元，这也是三元自2010年以来首次全年业绩出现亏损，上一次其年度亏损是因为2009年收购三鹿所致。
对于业绩亏损的原因，三元方面解释为，一方面原辅材料（原辅材料项目可行性研究报告）价格上涨导致公司产品成本上升，另一方面，受市场因素影响，产品毛利率下降，投资收益同比下降，导致净利润减少。
值得注意的是，为了弥补奶源紧张导致的成本上涨，三元还率先对旗下液态奶调价，从而引发光明、蒙牛等跟风，但从其业绩预报来看，提价并没有弥补三元的亏损。而且同样受困原材料价格上涨增加生产成本的蒙牛和光明乳业等其他乳企却一直保持业绩增长的状态。
对此，中国奶业协会理事陈瑜表示，作为一家立足于北京市场、主打巴氏奶的区域乳品企业，三元一直试图突破区域、做全国市场，但近年来随着蒙牛、伊利围攻北京市场，三元陷入市场接连失守的困境。加之原奶供应紧张的整体环境，三元可谓腹背受敌，不排除再度涨价以缓解业绩的可能性。