近几年来，我国一直是世界上最大的棉花消费国和原棉进口国。质量各异、包装五花八门的多国棉花在国内市场流通时带来了种种问题。
货证不同行，进口棉由商检局强制检验，但检验结果主要用于对外商索赔，且出证周期长，绝大多数通关棉花在证书没有出来时就已经卖完，几乎所有的最终用户根本没有见到商检局质量检验证书。棉花等级完全靠卖方报出，买方现场看货认可成交。虚报等级是普遍现象，且大多以英制和外国标准报检。商检的过磅码单在流通中也只有复印件且没有商检印章。
以次充好，商检码单造假的问题普遍。从网上看到报出的质量与到现场看到的棉花（棉花项目可行性研究报告）质量对比，80%以上的棉花存在虚高等级，以次充好。主要反映在级别、长度上。
净重计算差异很大，特别是印度棉在加工环节人为过多加水问题突出，造成棉花回潮率高、霉变板结、亏重等问题。在国内流通环节，一些储存仓库和经销商也人为地向成包棉花中加水。
另外，还有很多其他问题，如：霸王条款合同比比皆是，大多数购销合同都有“质量问题，以现场看大货为准，无质量索赔”的条款。差异很大的各国标准使消费者无所适从。掺杂掺假问题时有发现。进口棉质量在国内流通领域中的监管存在盲区。
根据《中华人民共和国产品质量法》《标准化法》《计量法》和《棉花质量监督管理条例》的规定，只要是在中华人民共和国境内经营棉花商品，就必须要遵守以上法律法规。我们完全有理由要求进入我国的棉花符合我国有关标准。有中文标识，否则拒绝通关或进行处罚。在国内经营环节必须货证相符，货证同行（没有商检证书，可以由经营企业或以委托检验的形式出具质量证书、报告）。取消霸王条款，以检验证书质量为准，有争议可以到进出口商品检验局或专业纤维检验机构仲裁并以仲裁结果为准。对掺杂掺假、以次充好按照有关法律法规，在国内贸易中由专业纤维检验机构进行监督管理和处罚。