肉牛产业是畜牧业发展的重要组成部分，种群资源又是影响肉牛产业（肉牛市场调查研究报告）的关键。近日，全国畜牧总站公布了2016年畜牧良种补贴项目的种公牛站及种公牛名单，其中种公牛36个品种，共1748头。统计发现，仅荷斯坦牛这一个品种的数量就达640头之多，乳肉兼用西门塔尔牛和肉用西门塔尔牛数量共525头，而国内常见品种如夏南牛、秦川牛等品种，数量均不足50头。我国肉牛自主育种薄弱的现状可见一斑。今年7月，农业部发布的《全国草食畜牧业发展规划(2016~2020年)》明确指出，要扎实推进良种繁育体系建设。“我国肉牛产业发展面临种群资源不足、技术突破困难等问题，当前，国外的品种的确远优于国内品种。”国家肉牛牦牛产业技术体系首席科学家、中国农业大学教授曹兵海认为，推广我国自主培育的肉牛仍任重道远。
中国畜牧业协会牛业分会发布的《2016年牛业发展报告》显示，我国肉牛屠宰胴体重长期处于世界平均水平之下，暴露出肉牛生产效率较低的问题，而首要原因，就是肉牛良种化程度偏低。中国畜牧业协会统计数据显示，当前全国改良肉牛比例不及50%，且部分地区由于管理不善，出现引种退化现象。尽管我国肉牛业在育种领域取得了一定成效——通过国家鉴定成功培育的专门化肉牛已有夏南牛、延黄牛、辽育白牛、云岭牛四个品种，但培育新品种的市场优势尚未充分体现，难以满足国内对于优质肉牛生产及消费的需要。产自吉林省延边朝鲜族自治州的延黄牛育种较早，2008年国家质检总局审核后，就决定对延边黄牛肉实施国家地理标志产品保护，但长期以来，推广效果并不显著；夏南牛产自河南，主要在中原地区推广养殖，关注产业发展较早，并充分利用召开产业发展大会等契机扩大影响，堪称国内自主育种肉牛宣传推广的“先行者”；历时34年选育开发的辽育白牛，近几年宣传推广的力度加大，大有赶超夏南牛之势；而云岭牛2014年才通过国家畜禽遗传资源委员会的最终审定，从选育成功至今时间较短，处于推广开发初期。
对当前国内肉牛育种推广工作中存在的问题，曹兵海认为主要有三点：育种方向选择不当、母牛资源受限、资金投入不足。面对国外肉牛良种的严峻挑战，目前国内出现了两种趋向：一是养牛企业依赖外国品种，需要年年进口；二是从本地牛某些个别特点出发，对其进行品种选育。尽管肉牛育种阻碍重重，可国内育种工作也没有有丝毫“懈怠”。
农业部近期发布的《关于促进现代畜禽种业发展的意见》明确提出，要打造一批大型畜禽种业集团和民族品牌。到2025年，主要畜种核心种源自给率要达到70%，基本建成与现代畜牧业相适应的良种繁育体系。“国内肉牛育种工作已经进行了很长时间，取得了一定成效，可未来仍需要漫长的时间去推广、应用。可以适当参考西方的一些育种经验，但不能照搬。”曹兵海认为，今后育种要从市场层面逆向思考，通过生产端和消费端的有机联合，来决定未来的育种方向。肉牛育种也将会逐渐按照政府主导、政府引导、政府辅助直至完全放手不干预的方向去发展，给育种更多自主性。吸引更多外来资金投入、帮扶，增强育种单位的发展活力是解决途径。