2013年，泉州检验检疫局共检验监管出口水产品（水产品项目可行性研究报告）1469批、5.58万吨、货值1.87亿美元，同比分别增长93.0%、98.0%和117.2%。2013年，泉州市水产品出口额首次突破1.8亿美元，创历史新高。
2013年，泉州主要出口水产品有冻海捕鱼、冻鱿鱼、冷冻鱼糜、鱿鱼干等，输往欧盟、美国、加拿大、日本、东南亚、非洲等30多个国家和地区。其中出口欧盟、美国高端市场的份额分别为2011.1万美元和640.9万美元，同比分别增长20.0%和1.2倍，其单价高于辖区出口平均价近1倍；出口鱿鱼干1322.3吨、2727.1万美元，分别比增9.4倍和10倍。此外，2家企业成功开发水产品罐头，共出口1457.4吨、货值376.7万美元，同比分别增长15.1倍和7.4倍。
为保持水产品出口良好增长势头，泉州检验检疫局积极帮扶15家出口水产品备案企业建立健全质量管理体系、强化源头管理、完善追溯体系，通过特色化风险分析以及个性化自检自控和动态化官方验证的特色监管机制，确保水产品质量安全。其中，帮促11家分获对欧盟、美国、韩国、巴西、印尼、越南等国注册，为开拓国际市场创造了条件。
同时，泉州检验检疫局通过创新检验监管模式、落实分类管理、推行直通放行等各项通关便利化措施，加快产品通关速度，降低物流成本，促进水产品出口。