全国144个国家级出口食品农产品质量安全示范区通过考核，福建省12个质量安全示范区榜上有名，其中水产行业（中国水产行业发展研究报告）占4个，分别是：东山县出口海捕水产品质量安全示范区；宁德市出口大黄鱼质量安全示范区；三明市梅列区出口鳗鱼产品质量安全示范区；长乐市出口鳗鱼产品质量安全示范区。
据了解，为提高该省食品农产品质量安全水平，促进食品农产品出口稳定增长，福建省政府办公厅于2010年下发《关于加快推进出口食品农产品质量安全示范区建设的意见》，在示范区建立“1种形式+4个体系”的出口食品农产品质量安全区域化综合管理模式，即推行“以加工企业为龙头、以农业合作组织为载体、以种养基地为基础、以标准为核心”的现代农业生产加工组织形式，建立健全政府质量安全公共管理体系、企业质量安全控制体系、风险预警与快速反应体系、技术服务支撑体系。
近年来，福建省各级渔业行政主管部门加强水产品养殖环节的质量安全监管及疫情疫病监测防控，养殖水域环境监管，渔业船舶安全生产监管和渔业港区的保洁管理，推动该省水产品出口稳步增长。2012年全省水产品出口创汇47.8亿美元，位居全国第二，占全省农产品出口总额68.87亿美元的63.2%。2013年1-11月份全省水产品出口额40.49亿美元，居全国首位。