为根治“瘦肉精”（中国瘦肉精快速检测试剂市场调查研究报告）违法问题，在前两年工作的基础上，2013年农业部继续在全国组织开展专项整治，督促指导各地深入实施《农业部关于深入推进“瘦肉精”专项整治工作的意见》，着力完善各项工作机制，取得了新的成效。
防止“瘦肉精”进入食品链，生产经营者是第一责任人，但监管部门有告知和指导的义务。高法、高检公布《关于办理危害食品安全刑事案件适用法律若干问题的解释》后，农业部及时举办培训班，邀请参与起草的同志进行解读，各地以此为重点开展了多种形式的普法宣传。截至2013年10月底，各级畜牧兽医部门共组织与“瘦肉精”有关的培训1.2万场次，通过媒体宣传4.67万次，发放宣传材料669万份。
在养殖相对分散、追溯体系尚未全面建成的现实条件下，抽检是质量安全监管不可或缺的手段。2013年，农业部继续组织实施养殖场户“瘦肉精”专项监测计划，在生猪养殖大省开展“瘦肉精”交叉拉网监测，对肉牛肉羊大省实施突击抽检，对公布禁用的“瘦肉精”类物质进行全面排查。各级畜牧兽医部门争取经费近5亿元，抽检各类样品941.4万批次。以屠宰环节为重点、各环节统筹兼顾的抽检制度基本形成。福建、浙江等省对定点屠宰场形成了“县级天天抽检，市级月月抽检，省级季度抽检”的工作制度。
经过连续3年持续推动，目前省际之间、部门之间协调配合渠道畅通，跨省案件通报协查、涉嫌犯罪移送等工作机制有效运转。据不完全统计，2013年各级畜牧兽医部门在“瘦肉精”专项整治中共立案查处违法案件309起，向公安机关移送63起。
据农业部监测，2013年畜产品“瘦肉精”抽检合格率99.7%，养殖环节活畜尿液抽检合格率99.9%，饲料样抽检合格率100%。各级畜牧兽医部门抽检各类样品941.4万批次，合格率99.95%。综合各方面的情况看，目前“瘦肉精”问题总体可控、稳定向好。下一步，农业部将认真贯彻中央农村工作会议和全国农业工作会议精神，继续毫不松懈地抓好“瘦肉精”监管。