有机农业理念是随着欧美发达国家石油农业带来的环境污染对人体健康影响日趋严重的背景下应运而生。过去20年，大陆有机农业由“萌芽起步”阶段发展到“初步发展”阶段，进入目前的规范快速发展阶段。
萌芽起步阶段(1989-1993年)，中国有机农业的起步始于20世纪80年代末。1989年，多年积极从事生态农业和有机农业农业研究、实践和推广的国家环境保护局南京环境科学研究所农村生态研究室加入国际有机农业运动联盟(IFOAM)，成为中国第一个IFOAM成员。
初步发展阶段(1994-2004年)，1994年，南京环境科学研究所的农村生态研究室经国家环境保护局批准，改为“国家环境保护局有机食品发展中心”，后称为“国家环境保护总局有机食品发展中心”(Organic Food Development Center of SEPA，OFDC)，负责开展有机农业的研究、宣传、培训和推广活动。之后，OFDC与世界各地的有机界同行建立了广泛的合作关系。这一阶段，大陆相继成立自己的有机认证机构，制定机构或部门推荐性行业标准，并开展相应的认证工作。
规范快速发展阶段(2005年至今)，2005年1月19日，中国国家质检总局和国家标准化管理委员会共同发布中国有机产品国家标准GB/T19630《有机产品》，并于2005年4月1日正式实施，同时《有机产品认证管理办法》、《有机产品认证实施规则》相继施行，标志着大陆有机农业进入规范发展阶段。
国际有机产品需求持续增长推动大陆有机农产品市场的迅速发展，有机农业进入快速发展时期，品种结构趋向多元化，生产、出口和国内市场增长迅速。近几年，中国有机食品的年出口额和年出口量增长率在30%以上。
大陆有机农业生产基地绝大多数分布在东部沿海地区和东北各省区。从数量和面积来看，东北三省和内蒙古最大;从产品加工程度和质量控制方面来看，上海、北京、浙江、山东和江苏等东部省份占较大优势;从发展速度来看，江苏、浙江等经济发达省份，江西、云南、内蒙古等环境优势省份近年发展迅速;从产品种类来看，有机和有机转换产品已有约50大类，400～500个品种，主要是蔬菜、水果、豆类、水产品和野生采集产品;从有机产品结构看，中国目前的有机产品主要为初级原料，加工产品较少，野生采集产品增长较快。
根据千讯咨询《中国农业行业发展研究报告》的数据，截至2013年已认证有机食品企业731家、产品3081个，认证面积达2644.7万亩，年销售额134.8亿元，出口额2000万美元;认证境外企业14家，产品86个。
千讯咨询高级分析师雷红生认为，随着我国经济的迅猛发展和综合国力的不断提升，人民群众生活水平不断提高，对高端农产品食品的刚性需求增长迅速，有机产品作为高端农产品食品的代表逐渐成为更多消费者的选择。近年来，不但我国有机产品逐渐从以出口为主转为出口和国内消费并重，而且越来越多的境外有机产品开始进入我国市场，并将我国作为其未来市场的主要增长点。在目前我国还未与任何一个国家和地区就有机产品认证达成双边或多边互认的情况下，境外产品在进入我国市场且以有机产品销售时，无论其是否通过境外相关有机产品认证机构认证，均必须通过我国具有资质的有机产品认证机构认证并在销售产品上标识我国有机产品标志。未来有机种植业的发展潜力巨大。